Diversity of FAAL enzymes and prediction of their substrate specificity using FAALPred
Leandro de Mattos Pereira†; Anne Liong†; Pedro N. Leão. † Contribuição igual entre Leandro de Mattos Pereira e Anne Liong.
Publicado pela primeira vez em 21 de janeiro de 2026. Bioinformática e IA foram usadas na mineração de clusters biossintéticos contendo enzimas FAAL e no desenvolvimento do FAALPred para predição de especificidade de substratos. O trabalho computacional contou com infraestrutura do Google Cloud em projeto aprovado na 2ª edição do Concurso de Computação Avançada: Inteligência Artificial em Cloud (Google/FCT), com Leandro de Mattos Pereira como PI e Pedro N. Leão como co-PI.
Biogas from slaughterhouse wastewater anaerobic digestion is driven by the archaeal family Methanobacteriaceae and bacterial families Porphyromonadaceae and Tissierellaceae
Camille E. Granada; Camila Hasan; Munique Marder; Odorico Konrad; Luciano K. Vargas; Luciane M.P. Passaglia; Adriana Giongo; Rafael R. de Oliveira; Leandro de Mattos Pereira; Fernanda de Jesus Trindade; Raul A. Sperotto.
Sequenciamento e análise bioinformática de comunidades microbianas para identificar famílias bacterianas e arqueanas associadas à produção de metano na digestão anaeróbia de efluente de frigorífico.
Coral microbiome manipulation elicits metabolic and genetic restructuring to mitigate heat stress and evade mortality
Santoro EP; Borges RM; Espinoza JL; Freire M; Pereira LDM; et al.; último autor: Peixoto RS.
Integração de abordagens de microbioma e expressão gênica para investigar reestruturação microbiana e metabólica em corais e apoiar estratégias de mitigação do estresse térmico.
SARS-CoV-2 mutations in Brazil: from genomics to putative clinical conditions
L. F. S. M. Timmers; J. V. Peixoto; R. G. Ducati; J. F. R. Bachega; L. P. de Mattos; R. A. Caceres; F. Majolo; G. L. da Silva; M. I. Goettert; O. A. Dellagostin; J. A. P. Henriques; L. L. Xavier; S. Laufer.
Vigilância genômica e modelagem estrutural de proteínas virais para mapear mutações do SARS-CoV-2 no Brasil e investigar possíveis impactos clínicos, imunológicos e epidemiológicos.
De novo transcriptome reveals blood coagulation/antithrombin factors and infection mechanisms in Angiostrongylus cantonensis adult worms
Leandro de Mattos Pereira; Milene Pereira Guimarães de Jezuz; Amaranta Ramos Rangel; Bruna Dalcin Baldasso; Amanda Bungi Zaluskic; Carlos Graeff-Teixeira; Alessandra Loureiro Morassutti.
Montagem de novo e anotação de transcriptoma para investigar vias ligadas à coagulação, antitrombina e mecanismos de infecção em A. cantonensis.
In depth transcriptome unravels the biotechnological potential of the Bothrops jararaca venom gland
Leandro de Mattos Pereira; Elisa Alves Messias; Bruna Sorroche; Angela das Neves Oliveira; Lidia Maria Rebolho Batista Arantes; Ana Carolina de Carvalho; Anita Mitico Tanaka-Azevedo; Kathleen Grego; André Carvalho; Matias Melendez.
Análise transcriptômica profunda da glândula de veneno de Bothrops jararaca para descoberta de toxinas, isoformas e famílias de proteínas com potencial biotecnológico e farmacêutico.
Mollusk microbiota shift during Angiostrongylus cantonensis infection in the freshwater snail Biomphalaria glabrata and the terrestrial slug Phillocaulis soleiformis
Leandro de Mattos Pereira†; Joana Borges Osório†; Alessandra Loureiro Morassutti; Jeremy Potriquet; Adriana Giongo; Renata Russo F. Cândido; Jason Mulvenna; Malcolm Jones; Carlos Graeff-Teixeira. † Contribuição igual entre Leandro de Mattos Pereira e Joana Borges Osório.
Perfilamento bioinformático de microbiota em hospedeiros intermediários para detectar mudanças associadas à infecção por A. cantonensis e investigar interações hospedeiro-parasito.
Microbiota Profile and Impact of Fusobacterium nucleatum in Colorectal Cancer Patients of Barretos Cancer Hospital
Ana Carolina de Carvalho; Leandro de Mattos Pereira; José Guilherme Datorre; Wellington dos Santos; Gustavo Noriz Berardinelli; Marcus de Medeiros Matsushita; Marco Antonio Oliveira; Ronilson Oliveira Durães; Denise Peixoto Guimarães; Rui Manuel Reis.
Análise integrada de microbiota e dados clínico-moleculares para avaliar Fusobacterium nucleatum e sua associação com características tumorais e desfechos em câncer colorretal.
Meiofaunal diversity in the Atlantic Forest soil: A quest for nematodes in a native reserve using eukaryotic metabarcoding analysis
Carla Müller; Leandro de Mattos Pereira; Carina Lopes; Juvenil Cares; Adriana Giongo; Luiz Gustavo dos Anjos Borges; Carlos Graeff-Teixeira; Alessandra Loureiro Morassutti.
Metabarcoding e bioinformática de alta vazão para caracterizar diversidade eucariota do solo, com foco em nematoides de uma reserva nativa da Mata Atlântica.
Mining of potential drug targets through the identification of essential and analogous enzymes in the genomes of pathogens of Glycine max, Zea mays and Solanum lycopersicum
Rangeline Azevedo da Silva; Leandro de Mattos Pereira; Melise Chaves Silveira; Rodrigo Jardim; Antonio Basilio de Miranda.
Pipeline in silico de genômica comparativa para identificar enzimas essenciais não homólogas em patógenos de soja, milho e tomate, priorizando potenciais alvos para controle fitossanitário.
Recycled paper sludge microbial community as a potential source of cellulase and xylanase enzymes
Heinz KGH; Zanoni PRS; Oliveira RR; Medina-Silva R; Simão TLL; Trindade FJ; Pereira LM; et al.
Análise funcional de comunidade microbiana associada a lodo de papel reciclado para prospecção de enzimas celulase e xilanase com potencial de aplicação industrial.
FAALPred
O artigo de 2026 em Protein Science apresenta a diversidade de enzimas FAAL e a predição de especificidade de substratos usando FAALPred. O desenvolvimento do FAALPred contou com infraestrutura de computação em nuvem obtida em competição/projeto de computação avançada Google/FCT, com Leandro de Mattos Pereira como PI e Pedro N. Leão como co-PI.